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點火問題
在分析工作中，經常會碰到部分儀器點火線圈不亮，無法正常點火。首先要檢查點火爐絲是否正常，如爐絲斷則需要更換爐絲，如爐絲亮但點不燃火焰，就需要檢查燃氣或控制閥，檢查爐絲與爐芯的位置是否合適，排除這些故障后儀器可正常點火。
無信號強度
在儀器檢定過程中，經常遇到儀器測量標準溶液后無響應熒光強度。遇到此類問題，首先，應該檢查靜態光源，檢查元素燈是否點亮。若儀器燈能量正常，說明儀器電路部分正常，則需要進一步檢查反應系統或原子化系統。檢查儀器泵管松緊是否合適，管道有無堵塞破裂。如出現上述情況，試劑沒有進系統，儀器沒有發生氧化還原反應，則不會產生信號。更換管道，調整泵管松緊可以解決此問題。
檢定標準溶液的酸度或還原劑濃度不夠，不能生成被測元素的氫化物，無法正常原子化也會造成儀器無響應熒光強度，這就需要檢查配置標準溶液所使用的酸和還原劑濃度。
儀器靈敏度低
在檢定過程中，由于要檢定儀器的測量線性及檢出限，需要在儀器上測量0.0 ng/mL、1.0 ng/mL、5.0 ng/mL、10.0 ng/mL砷銻混合標準溶液的線性。重復測量3次，記錄熒光強度值，按照線性回歸計算斜率b，再對空白溶液連續進行11次熒光強度測量，計算其標準偏差，然后計算儀器的檢出限QL。JJG939-2009《原子熒光光度計檢定規程》要求儀器檢出限為0.4 ng。檢定中經常碰到儀器靈敏度低，調整儀器的燈電流和負高壓后仍無法達到檢定規程的要求，這就需要排查解決靈敏度低的問題。
首先檢查爐絲是否老化，必要時更換爐絲，然后檢查原子化器位置是否偏移造成焦距的變化而影響儀器的靈敏度。調光不好，焦距不在爐芯中心也會造成儀器靈敏度低，這就需要重新調整爐芯和光路位置。載氣流量低，排廢太快，載流管或毛細管變形或折彎等原因，都會造成標準溶液無法正常原子化而導致儀器靈敏度降低，這就需要檢查儀器的進樣系統，有必要時需更換儀器進樣系統管路。在檢定過程中，經常碰到儀器所使用的氬氣純度不夠而造成儀器靈敏度降低，更換高純度氬氣后可解決此問題。所選用元素燈的強度也會對儀器的靈敏度造成影響，在儀器靈敏度較低時需要更換元素燈。
儀器信號不穩定
可以降低儀器的燈電流和負高壓后信號值，如果還是不穩定，這時需要檢查儀器所處的環境是否有強光干擾，儀器的檢測窗口若有強光照射，會引起儀器熒光信號不穩定，這就需要遮光進行檢定。然后觀察儀器的火焰是否跳動，若有明顯跳動則檢查儀器抽排風口是否抽力太大，有氣流影響而造成儀器火焰不穩定。
排除上述問題后，儀器信號仍不穩定，就需要檢查儀器的水封、廢液管，水封和廢液管不暢會導致水分進入原子化器，造成儀器信號不穩定。這需要重新調整儀器的水封和廢液管位置。在檢定中碰到儀器載流過大而造成儀器信號不穩定，需要降低載氣流速。經過以上排查過程，基本可以保證儀器測量的信號穩定。
測量空白高
對于熒光儀在使用過程中出現空白偏高的現象，可能有載流的問題，空白溶液的問題，管道和管路污染問題等，在日常檢定過程中，通過調整燈電流和負高壓將測量儀器載流的熒光強度值保持在200左右，而有部分儀器的載流空白強度值達到了1000左右，這影響了儀器的線性測量。而這類問題大都因為試劑問題，如鹽酸等。由于檢定用標準溶液需要現場配置，對配置溶液所用的容量瓶、移液管等玻璃量器也要清洗干凈，降低對儀器測量結果的影響。而當載流、標樣、樣品的熒光值為零，甚至為負數時，應首先確認光源、蠕動泵是否能正常工作，還要確認泵管是否卡到合適的位置、載流和還原劑通路是否順暢等，確認儀器內部的氣液分離裝置通往原子化器的管路是否堵塞。對于標樣熒光值與以往測定值差異大，應首先確認標樣配制無誤，然后確認元素燈是否安裝至正常位置，還要檢查還原劑濃度是否過低，夏天建議每半天就要重新配置還原劑。
基線漂移或噪音
穩定的基線應該是一條直線，保持基線平穩，是進行分析的基本的要求。如做載流空白時，有時會出現基線上漂、下漂、脈沖或呈梯度現象，這樣會影響對光譜峰的準確判定。其原因可能是：
儀器本底熒光強度有漂移、光源不穩定、電源不穩定、載流或還原劑不干凈、管路或石英管臟等。對于本底熒光強度漂移，可以空啟動儀器不進樣，確認是哪個通道的燈不穩定產生的，也可實際測量，看儀器熒光強度是否有漂移，如有，則有可能是由泵管的疲勞引起的漂移，但泵管疲勞的確認是在排除光源和本底漂移后方可判定。對于載流或還原劑不干凈、管路或石英管臟等問題，應*沖洗儀器管路及流路系統。還應配備穩壓電源。對于出現噪音現象，可能是儀器還沒穩定，氣路不穩定、燈預熱的時間不夠、環境溫度變化幅度大等，實驗中應注意這些問題。
熒光值普遍偏低
當熒光值普遍偏低時，應確認氬氣壓力是否滿足測定要求，其次要確認原子化器中的石英爐芯是否干凈或是否堵塞，冬天要保持室溫在25℃左右，溫度過低熒光值會普遍偏低。
處理方式有：打開主機蓋，調整元素燈至合適的位置，如果是測汞，可以更換一級氣液分離器出氣口到二級氣液分離器之間的毛細管(毛細管中潮濕容易照成汞吸附在管壁，從而熒光值偏低)，來改善熒光強度。儀器進樣管路密封性必須良好，否則會導致檢測結果偏低。排除廢液的泵要調節到合適的程度，泵管壓塊壓的過緊，容易導致泵管提早老化，過松會導致廢液不能及時排出，多余的廢液會從氣液分離器頂端的出氣口反沖到二級氣液分離器中，廢液會溢出到爐腔中如不及時清理會腐蝕爐腔，過多的廢液還有可能噴到原子化氣中造成石英爐芯炸裂。另外抽風口的風力過大，會照成儀器不穩定，有可能會導致檢測結果偏低。(使用該儀器時發現石英進樣針極易損壞，為了避免進樣針損壞，在測試結束后先取下進樣針放在載流瓶內，然后再取下載流槽倒掉多余的酸液，清洗載流槽，在下次開機測試前重新裝回進樣針。)另外，每次更換元素燈必須要重新聚焦。每隔2個月將儀器的所有配件卸下，進行*地清洗，烘干后再重新安裝使用。
